62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2440 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2440  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  283  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0311  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  283  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0054  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  283  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0606  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  283  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1014  hypothetical protein  98.57 
 
 
140 aa  279  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0849  hypothetical protein  98.57 
 
 
140 aa  279  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0854  hypothetical protein  98.57 
 
 
140 aa  279  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0676  hypothetical protein  89.29 
 
 
140 aa  236  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0683  hypothetical protein  71.68 
 
 
146 aa  175  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.80939  normal  0.421204 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2615  hypothetical protein  73.45 
 
 
145 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2644  hypothetical protein  73.45 
 
 
145 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2005  hypothetical protein  73.45 
 
 
145 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.643515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5946  hypothetical protein  71.68 
 
 
145 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2535  hypothetical protein  68.14 
 
 
148 aa  166  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.753717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2662  hypothetical protein  68.14 
 
 
148 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0702  hypothetical protein  53.12 
 
 
165 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3264  hypothetical protein  63.72 
 
 
165 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.59265  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0472  hypothetical protein  62.83 
 
 
165 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.323854  normal  0.0568179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1682  hypothetical protein  41.98 
 
 
135 aa  96.7  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1556  hypothetical protein  38.89 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0055  hypothetical protein  38.89 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.705934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1468  hypothetical protein  38.89 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12597  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1308  hypothetical protein  40 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5871  hypothetical protein  34.11 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.652462  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1517  hypothetical protein  33.57 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1525  hypothetical protein  33.83 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5613  hypothetical protein  36.36 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0396148  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0225  hypothetical protein  44.33 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6217  hypothetical protein  33.08 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.229916  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1104  putative signal peptide exported protein  33.08 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1390  hypothetical protein  32.35 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4531  hypothetical protein  37.5 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674872  normal  0.0487263 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4398  hypothetical protein  37.5 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0007  hypothetical protein  33.58 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1891  putative signal peptide exported protein  31.93 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460761  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2835  hypothetical protein  37.37 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6253  hypothetical protein  31.16 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396801  normal  0.520881 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0424  hypothetical protein  38.14 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0416  hypothetical protein  38.14 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2618  hypothetical protein  38.68 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0317  hypothetical protein  34.58 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0165293  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1190  putative signal peptide protein  37.12 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0908829  normal  0.0329477 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4413  hypothetical protein  37.5 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.937751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1971  putative signal peptide protein  33.02 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.238735  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1251  putative signal peptide protein  36.36 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00518719  normal  0.758996 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4546  hypothetical protein  37.5 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0051838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3525  hypothetical protein  32.32 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.304757  normal  0.481308 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0607  hypothetical protein  37.11 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0807716  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1998  putative signal peptide protein  36.11 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2702  hypothetical protein  31.78 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.936716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1315  putative signal peptide protein  34.68 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3646  hypothetical protein  34.62 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3153  hypothetical protein  31.78 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232166  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0066  hypothetical protein  30.83 
 
 
271 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1166  hypothetical protein  32.5 
 
 
192 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1210  hypothetical protein  26.98 
 
 
169 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.651462  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2561  hypothetical protein  29.08 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0006  hypothetical protein  28.45 
 
 
170 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1140  hypothetical protein  29 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2084  hypothetical protein  28.97 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499174  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0619  hypothetical protein  29.59 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1232  hypothetical protein  26.98 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>