64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1315 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1315  putative signal peptide protein  100 
 
 		 141 aa  291  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1190  putative signal peptide protein  86.52 
 
 		 141 aa  256  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0908829  normal  0.0329477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1251  putative signal peptide protein  84.4 
 
 		 141 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00518719  normal  0.758996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2618  hypothetical protein  63.89 
 
 		 175 aa  154  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3646  hypothetical protein  55.91 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1971  putative signal peptide protein  53.6 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.238735  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1998  putative signal peptide protein  55.96 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4480  hypothetical protein  41.98 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3517  hypothetical protein  44.9 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4000  hypothetical protein  44.9 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  0.295716 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4106  hypothetical protein  45.92 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4260  hypothetical protein  45.92 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3417  hypothetical protein  45.92 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1938  hypothetical protein  43.88 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228062  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2835  hypothetical protein  47.87 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0424  hypothetical protein  39.55 
 
 		 162 aa  76.6  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0416  hypothetical protein  39.55 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0225  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0317  hypothetical protein  34.65 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0165293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1308  hypothetical protein  36.44 
 
 		 284 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1468  hypothetical protein  37.29 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12597  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1556  hypothetical protein  37.29 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2535  hypothetical protein  36.89 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.753717 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0055  hypothetical protein  37.29 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.705934  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2644  hypothetical protein  39.78 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2005  hypothetical protein  39.78 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.643515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2615  hypothetical protein  39.78 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22957  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0607  hypothetical protein  31.43 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0807716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2662  hypothetical protein  36.89 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5946  hypothetical protein  39.78 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0683  hypothetical protein  39.78 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.80939  normal  0.421204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5613  hypothetical protein  34.78 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0396148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0676  hypothetical protein  42.68 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0702  hypothetical protein  32.32 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4413  hypothetical protein  36.96 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.937751 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4546  hypothetical protein  36.96 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0051838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0472  hypothetical protein  36.89 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.323854  normal  0.0568179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3264  hypothetical protein  41.98 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.59265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1525  hypothetical protein  29.37 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1682  hypothetical protein  33.86 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0606  hypothetical protein  34.68 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1104  putative signal peptide exported protein  33.33 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0311  hypothetical protein  34.68 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0054  hypothetical protein  34.68 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2440  hypothetical protein  34.68 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1014  hypothetical protein  38.2 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0854  hypothetical protein  38.2 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0849  hypothetical protein  38.2 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5871  hypothetical protein  31.63 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.652462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6217  hypothetical protein  33.67 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2702  hypothetical protein  31.82 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936716 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1517  hypothetical protein  31.48 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1891  putative signal peptide exported protein  33.62 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460761  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4531  hypothetical protein  33.68 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674872  normal  0.0487263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3153  hypothetical protein  30.61 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4398  hypothetical protein  33.68 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2561  hypothetical protein  29.93 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1390  hypothetical protein  31.07 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6253  hypothetical protein  28.3 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396801  normal  0.520881 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3525  hypothetical protein  31.43 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.304757  normal  0.481308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2084  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1166  hypothetical protein  28.3 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0066  hypothetical protein  26.89 
 
 		 271 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1232  hypothetical protein  29.59 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>