15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4106 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4260  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4106  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3417  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549592  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1938  hypothetical protein  84.83 
 
 
145 aa  248  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228062  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4000  hypothetical protein  76.39 
 
 
146 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  0.295716 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3517  hypothetical protein  75.69 
 
 
150 aa  216  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4480  hypothetical protein  71.63 
 
 
138 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3646  hypothetical protein  34.53 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1190  putative signal peptide protein  46.94 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0908829  normal  0.0329477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1251  putative signal peptide protein  47.96 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00518719  normal  0.758996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1315  putative signal peptide protein  45.92 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2618  hypothetical protein  42.27 
 
 
175 aa  89.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1998  putative signal peptide protein  39.18 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1971  putative signal peptide protein  36.08 
 
 
158 aa  77  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.238735  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2835  hypothetical protein  28.86 
 
 
158 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>