30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2901 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2901  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 79 aa  154  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1406  prevent-host-death family protein  48.72 
 
 		 79 aa  84  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1670  prevent-host-death family protein  52.56 
 
 		 80 aa  83.6  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  39.74 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0479  prevent-host-death family protein  41.56 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1816  prevent-host-death family protein  40.24 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000021208  hitchhiker  0.0000000000223341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  68.42 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4443  prevent-host-death family protein  46.03 
 
 		 72 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  40.45 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1545  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0553  prevent-host-death family protein  42.59 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4108  prevent-host-death protein  44.23 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  39.06 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1433  prevent-host-death protein  57.89 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205341  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3107  prevent-host-death family protein  40.38 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0911867  normal  0.278204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  52.27 
 
 		 92 aa  43.9  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4434  prevent-host-death protein  48.72 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0804206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2929  prevent-host-death family protein  45.24 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  39.02 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2981  PHD family antitoxin/ParA family chromosome partitioning ATPase  54.05 
 
 		 341 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1539  prevent-host-death family protein  54.05 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  47.83 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10637  hypothetical protein  40.38 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000182741  normal  0.496529 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0205  prevent-host-death family protein  39.06 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  38.3 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3077  prevent-host-death protein  35.82 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0261  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.879783  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13419  hypothetical protein  51.22 
 
 		 102 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000985645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  36.96 
 
 		 96 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>