24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2515 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2515  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0537  hypothetical protein  70.43 
 
 		 115 aa  173  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0279  hypothetical protein  33.63 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.457399  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  33.63 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  33.93 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4168  hypothetical protein  35.45 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000529234  decreased coverage  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0696  hypothetical protein  32.17 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0776606  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1681  hypothetical protein  34.95 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000243963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  31.3 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  32.2 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  34.62 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5532  hypothetical protein  28.32 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2989  hypothetical protein  31.68 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6320  hypothetical protein  31.37 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  35 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  27.83 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0170  hypothetical protein  29.03 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1155  hypothetical protein  25.89 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0675  hypothetical protein  25.86 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  33.75 
 
 		 122 aa  40.8  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2621  hypothetical protein  37.04 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  31.25 
 
 		 120 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4900  hypothetical protein  32.43 
 
 		 158 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.991868  normal  0.739115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>