25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1646 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1646  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 113 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0702167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0282  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2315  DNA polymerase beta domain protein region  38.2 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759892  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2407  DNA polymerase beta domain protein region  45.35 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3265  DNA polymerase beta domain protein region  38.68 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.165533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2832  DNA polymerase beta domain protein region  38.68 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0280  DNA polymerase beta subunit  37.23 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000175333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2250  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2754  hypothetical protein  34.48 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604602  hitchhiker  0.000634444 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0518  hypothetical protein  41.43 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3517  DNA polymerase beta subunit  43.75 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.909261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.23 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3358  hypothetical protein  30.77 
 
 		 265 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0416  hypothetical protein  38.37 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0566147 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0175  DNA polymerase beta subunit  39.53 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2319  DNA polymerase, beta-like region  35.63 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000830496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4093  DNA polymerase beta subunit  37.29 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.792908  normal  0.694143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  34.09 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0600  hypothetical protein  39.44 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4369  hypothetical protein  32.5 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  34.74 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  35 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4308  hypothetical protein  32.5 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  34.72 
 
 		 137 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>