17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4885 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4885    100 
 
 		 985 bp  1953    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3200    87.61 
 
 		 123 bp  113  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6150    82.32 
 
 		 364 bp  107  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6989  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  85.23 
 
 		 1065 bp  63.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5331  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  93.18 
 
 		 1041 bp  63.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51032 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7010  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  92.68 
 
 		 1053 bp  58  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  100 
 
 		 1977 bp  56  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2396  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  94.44 
 
 		 1050 bp  56  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7019    90.24 
 
 		 1037 bp  50.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1335  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 2943 bp  50.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1959 bp  50.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  96.55 
 
 		 2520 bp  50.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2988  DNA ligase, ATP-dependent  100 
 
 		 3492 bp  50.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3112  DNA ligase D  100 
 
 		 3474 bp  50.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  96.55 
 
 		 2520 bp  50.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  96.55 
 
 		 2520 bp  50.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5730  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  88.64 
 
 		 1053 bp  48.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>