36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3262 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3262  protein of unknown function DUF423  100 
 
 		 123 aa  229  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.319272 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3011  protein of unknown function DUF423  91.06 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  56.41 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2331  hypothetical protein  53.33 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  44.74 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  48.67 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  47.62 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  38.21 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  37.82 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  37.82 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  45.56 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  41.3 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04960  hypothetical protein  41.38 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0478  hypothetical protein  41.38 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324677  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  42.39 
 
 		 122 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  45.88 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3804  hypothetical protein  32.77 
 
 		 131 aa  43.9  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00311639  unclonable  0.0000000190492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2349  hypothetical protein  44.71 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  37.96 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5332  hypothetical protein  35.45 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.423162  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4742  hypothetical protein  38.32 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0432  hypothetical protein  37.38 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0928  hypothetical protein  29.84 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438881  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3376  hypothetical protein  29.03 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004250  hypothetical protein  31.82 
 
 		 132 aa  42  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000539124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5156  hypothetical protein  37.27 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444342  normal  0.879938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5379  protein of unknown function DUF423  51.06 
 
 		 123 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4979  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0681  hypothetical protein  54.05 
 
 		 122 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5106  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.167348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0692  membrane protein  30.83 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.874009  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01185  hypothetical protein  31.19 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2306  protein of unknown function DUF423  44.71 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.454103  normal  0.0930723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3253  hypothetical protein  29.82 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.222088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5083  hypothetical protein  44.29 
 
 		 134 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225516  normal  0.744804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>