29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1021 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  94.36 
 
 		 195 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  64.62 
 
 		 195 aa  255  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  51.53 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  48.15 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  48.15 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  45.88 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  44.44 
 
 		 237 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  41.14 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  36.31 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  43.86 
 
 		 250 aa  128  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  38.19 
 
 		 243 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  40 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  40.34 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  35.42 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  36.65 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  35.11 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  35.45 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  34.9 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  37.29 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  34.91 
 
 		 192 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  34.32 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  32.8 
 
 		 192 aa  98.6  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  31.52 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  31.95 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  27.89 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  26.79 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  25.79 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  24.03 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>