27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3088 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3345  hypothetical protein  85.83 
 
 		 841 aa  1360    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172568  decreased coverage  0.00479246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3088  hypothetical protein  100 
 
 		 836 aa  1668    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671976  normal  0.139652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2615  hypothetical protein  47.55 
 
 		 766 aa  337  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3542  hypothetical protein  43.3 
 
 		 715 aa  308  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652953  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1232  hypothetical protein  40.72 
 
 		 479 aa  233  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1625  hypothetical protein  39.61 
 
 		 465 aa  218  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1681  hypothetical protein  39.61 
 
 		 465 aa  218  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571535  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3157  hypothetical protein  41.52 
 
 		 544 aa  206  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0907045  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2964  hypothetical protein  38.65 
 
 		 540 aa  156  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1124  hypothetical protein  38.16 
 
 		 518 aa  153  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4773  hypothetical protein  40.11 
 
 		 534 aa  151  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1851  hypothetical protein  37.2 
 
 		 546 aa  146  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4085  hypothetical protein  35.92 
 
 		 553 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414268  normal  0.0981997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1331  hypothetical protein  37.14 
 
 		 540 aa  144  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3893  hypothetical protein  38.42 
 
 		 541 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0724599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0286  hypothetical protein  31.3 
 
 		 499 aa  125  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  35.67 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0036  hypothetical protein  34.48 
 
 		 460 aa  119  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7582  hypothetical protein  33.89 
 
 		 409 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1000  hypothetical protein  32.07 
 
 		 492 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0963  hypothetical protein  32.07 
 
 		 493 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.373348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  33.17 
 
 		 1680 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1006  hypothetical protein  38.89 
 
 		 634 aa  105  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5639  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 496 aa  104  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  0.277349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0941  hypothetical protein  31.47 
 
 		 493 aa  104  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6846  hypothetical protein  32.77 
 
 		 414 aa  104  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1763 aa  104  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>