34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1396 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1396  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 132 aa  249  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.955591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  96.21 
 
 		 132 aa  184  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4727  protein of unknown function DUF1236  90.91 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6932  protein of unknown function DUF1236  80.49 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  53.33 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0791  protein of unknown function DUF1236  80.51 
 
 		 131 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1430  hypothetical protein  59.7 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731285  hitchhiker  0.000462383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  59.85 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  65.59 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  65.75 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3557  hypothetical protein  60.27 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0356  hypothetical protein  44.74 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  52.27 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  45.35 
 
 		 221 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  44.19 
 
 		 221 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  44.19 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  54.63 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  43.62 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  49.24 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  37.21 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  37.86 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  36.51 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  37.14 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  37.72 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  43.24 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4377  hypothetical protein  49.28 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  32.62 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  44.44 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  35.62 
 
 		 466 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  53.12 
 
 		 264 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4035  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  42  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662929  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  35.71 
 
 		 205 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  35.71 
 
 		 205 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  45.45 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>