29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0893 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  100 
 
 
195 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  94.36 
 
 
195 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  63.08 
 
 
195 aa  246  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  51.53 
 
 
215 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  48.68 
 
 
203 aa  173  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  48.68 
 
 
203 aa  173  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  46.39 
 
 
200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  37.43 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  41.14 
 
 
227 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  39.7 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  41.14 
 
 
243 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  43.27 
 
 
237 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  44.19 
 
 
250 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  43.03 
 
 
227 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  35.42 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  34.9 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  36.9 
 
 
192 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  34.9 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  34.97 
 
 
191 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  36.72 
 
 
192 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  35.5 
 
 
192 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  32.81 
 
 
192 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  34.32 
 
 
192 aa  97.8  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  31.95 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  31.52 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  27.57 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  27.98 
 
 
194 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  26.42 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  24.03 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>