28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0028 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0028  Peptidase M15A  100 
 
 
142 aa  288  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0040  Peptidase M15A  84.51 
 
 
142 aa  247  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1451  peptidase M15A  45.45 
 
 
433 aa  86.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556547  hitchhiker  0.00120403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  46.08 
 
 
459 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  40.78 
 
 
347 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1742  Peptidase M15A  39.81 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000376247  normal  0.422133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  43.27 
 
 
421 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  51.95 
 
 
426 aa  67  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0205  hypothetical protein  44.59 
 
 
186 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.187216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  42.62 
 
 
183 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  47.17 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  45.28 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  45.28 
 
 
182 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  45.28 
 
 
182 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  45.28 
 
 
182 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1893  hypothetical protein  45.28 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1899  hypothetical protein  45.28 
 
 
182 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1925  hypothetical protein  45.28 
 
 
182 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1932  hypothetical protein  45.28 
 
 
182 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2394  protein of unknown function DUF882  45.28 
 
 
182 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0868273  normal  0.0323721 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  43.4 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1782  hypothetical protein  37.08 
 
 
225 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.043222 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  37.78 
 
 
224 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  47.17 
 
 
203 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  36.99 
 
 
182 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  45.28 
 
 
187 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3192  protein of unknown function DUF882  36.96 
 
 
273 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559007  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1445  hypothetical protein  35.56 
 
 
183 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485223  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>