96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1591 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4469  hypothetical protein  86.1 
 
 		 395 aa  731    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2882  hypothetical protein  84.86 
 
 		 395 aa  717    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3160  hypothetical protein  76.67 
 
 		 393 aa  634    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1659  hypothetical protein  82.38 
 
 		 395 aa  697    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1091  hypothetical protein  82.63 
 
 		 393 aa  679    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.613907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2359  hypothetical protein  81.64 
 
 		 395 aa  676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.588957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3559  hypothetical protein  84.37 
 
 		 395 aa  714    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306765  normal  0.452046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0858  hypothetical protein  84.28 
 
 		 407 aa  719    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3954  hypothetical protein  80.65 
 
 		 395 aa  669    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1219  hypothetical protein  84.94 
 
 		 405 aa  721    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.698827  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1591  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  836    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.66492  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0927  hypothetical protein  71.36 
 
 		 391 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.045473  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0996  hypothetical protein  69.88 
 
 		 391 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.397652  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0862  hypothetical protein  70.62 
 
 		 391 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0358737  normal  0.649536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0984  hypothetical protein  70.12 
 
 		 391 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2102  hypothetical protein  69.63 
 
 		 391 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1021  hypothetical protein  69.63 
 
 		 391 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1230  VWA containing CoxE family protein  67.65 
 
 		 391 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.853007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3316  hypothetical protein  68.4 
 
 		 391 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2372  hypothetical protein  67.16 
 
 		 391 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5675  hypothetical protein  66.67 
 
 		 391 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2333  VWA containing CoxE family protein  66.42 
 
 		 391 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1330  hypothetical protein  65.68 
 
 		 798 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1721  VWA containing CoxE-like  66.42 
 
 		 391 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0167307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2356  VWA containing CoxE family protein  66.67 
 
 		 391 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2252  hypothetical protein  66.67 
 
 		 391 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0944  VWA containing CoxE family protein  66.17 
 
 		 391 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.248331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1177  hypothetical protein  65.68 
 
 		 391 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0298  hypothetical protein  65.68 
 
 		 391 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1169  hypothetical protein  65.68 
 
 		 391 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1015  hypothetical protein  65.68 
 
 		 391 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1937  hypothetical protein  65.68 
 
 		 391 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0236151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0850  hypothetical protein  65.68 
 
 		 391 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207331  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0964  hypothetical protein  65.43 
 
 		 391 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0815038  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0905  hypothetical protein  62.01 
 
 		 391 aa  502  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.687363  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1315  hypothetical protein  58.87 
 
 		 392 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4574  hypothetical protein  58.87 
 
 		 392 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0368264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1604  hypothetical protein  57.64 
 
 		 392 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1383  VWA containing CoxE family protein  58.42 
 
 		 392 aa  488  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3874  hypothetical protein  58.87 
 
 		 392 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0400507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4095  hypothetical protein  58.87 
 
 		 392 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0303832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3321  hypothetical protein  58.62 
 
 		 392 aa  485  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3906  hypothetical protein  57.64 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4135  hypothetical protein  55.91 
 
 		 391 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1408  hypothetical protein  57.64 
 
 		 392 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29160  hypothetical protein  56.9 
 
 		 393 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0682429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1787  hypothetical protein  57.64 
 
 		 392 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1913  hypothetical protein  55.42 
 
 		 391 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0562302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1579  hypothetical protein  57.39 
 
 		 392 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3459  hypothetical protein  55.42 
 
 		 411 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0190687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3982  hypothetical protein  57.14 
 
 		 393 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2124  hypothetical protein  55.17 
 
 		 391 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.466092  normal  0.0154138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32870  hypothetical protein  55.67 
 
 		 392 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6258  hypothetical protein  54.68 
 
 		 391 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3782  VWA containing CoxE family protein  57.28 
 
 		 390 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858588  normal  0.572955 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2515  hypothetical protein  56.05 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.762903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02166  hypothetical protein  55.56 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1409  hypothetical protein  55.17 
 
 		 392 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1642  hypothetical protein  55.77 
 
 		 392 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2057  hypothetical protein  52.97 
 
 		 390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3297  hypothetical protein  54.84 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.88869  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1511  hypothetical protein  56.19 
 
 		 391 aa  448  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1983  hypothetical protein  54.43 
 
 		 391 aa  448  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2871  hypothetical protein  53.94 
 
 		 391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.323163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2536  hypothetical protein  55.91 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129382  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0891  hypothetical protein  53.79 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0553053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6601  hypothetical protein  55.17 
 
 		 391 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458102  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1879  hypothetical protein  52.55 
 
 		 395 aa  440  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.453094  normal  0.342483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0516  hypothetical protein  56.05 
 
 		 391 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4250  hypothetical protein  52.93 
 
 		 395 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1945  hypothetical protein  55.42 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6064  hypothetical protein  53.94 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4979  hypothetical protein  53.45 
 
 		 391 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.042222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2685  hypothetical protein  51.1 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4929  hypothetical protein  52.71 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4465  hypothetical protein  52.71 
 
 		 391 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.795551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0810  hypothetical protein  51.34 
 
 		 407 aa  428  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.487209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2093  hypothetical protein  54.05 
 
 		 393 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0341328  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0803  hypothetical protein  49.76 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3988  VWA containing CoxE family protein  50.61 
 
 		 393 aa  418  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2650  hypothetical protein  51.59 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1718  hypothetical protein  49.28 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0616459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1307  hypothetical protein  51.34 
 
 		 394 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1187  hypothetical protein  50.61 
 
 		 394 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2133  hypothetical protein  40.15 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000802256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0107  hypothetical protein  42.26 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.183182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5019  VWA containing CoxE family protein  40.93 
 
 		 400 aa  295  7e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3607  hypothetical protein  39.76 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0048  hypothetical protein  34.83 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2235  VWA containing CoxE family protein  34.15 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0438  hypothetical protein  33.57 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1614  hypothetical protein  33.09 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2506  VWA containing CoxE family protein  27.18 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2766  hypothetical protein  20.05 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1429  hypothetical protein  21.74 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3718  hypothetical protein  19.53 
 
 		 354 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.625161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>