96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5686 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5686  ferredoxin  100 
 
 		 121 aa  245  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3549  ferredoxin  84.3 
 
 		 121 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4625  ferredoxin  84.3 
 
 		 121 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3357  ferredoxin  69.23 
 
 		 130 aa  160  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2790  ferredoxin  72.32 
 
 		 120 aa  159  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0213  ferredoxin  62.18 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.574609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2965  ferredoxin  62.73 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1325  ferredoxin  57.8 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.530714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0217  ferredoxin  50.91 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3094  ferredoxin  58 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.759467  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30560  Ferredoxin  47.27 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3791  ferredoxin  50.53 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108252  hitchhiker  0.00246562 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2278  hypothetical protein  48.18 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3312  hypothetical protein  44.9 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1473  ferredoxin  51.79 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 		 354 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.05 
 
 		 350 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.71 
 
 		 360 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.27 
 
 		 341 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2861  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 		 351 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.771556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.12 
 
 		 349 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.43 
 
 		 350 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.96 
 
 		 346 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.12 
 
 		 338 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  34.12 
 
 		 338 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  40 
 
 		 338 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4051  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.79 
 
 		 342 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548606  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  31.46 
 
 		 342 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  37.5 
 
 		 334 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 		 343 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 		 343 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 		 343 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 		 343 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 		 343 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 		 343 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 		 343 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.5 
 
 		 348 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.18 
 
 		 345 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08710  ferredoxin, XylT  46.67 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  43.06 
 
 		 349 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  40.68 
 
 		 592 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.75 
 
 		 348 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1770  putative flavodoxin oxidoreductase  32.53 
 
 		 486 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0104473  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  42.37 
 
 		 592 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.67 
 
 		 349 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.36 
 
 		 343 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.94 
 
 		 350 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.71 
 
 		 343 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.33 
 
 		 354 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.67 
 
 		 344 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1567  putative flavodoxin oxidoreductase  37.14 
 
 		 327 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.84 
 
 		 341 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.94 
 
 		 350 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.12 
 
 		 357 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.77 
 
 		 343 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.28 
 
 		 349 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  38.98 
 
 		 592 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  30.11 
 
 		 369 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.77 
 
 		 343 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2370  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.16 
 
 		 338 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1748  ferredoxin  37.14 
 
 		 351 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.764981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.67 
 
 		 336 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3790  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  44.68 
 
 		 346 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  35.62 
 
 		 343 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.16 
 
 		 337 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  31.46 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5674  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.95 
 
 		 332 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  29.03 
 
 		 369 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  29.03 
 
 		 369 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  29.03 
 
 		 369 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.06 
 
 		 367 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0528  ferredoxin  36.76 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  26.09 
 
 		 538 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  34.52 
 
 		 353 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47390  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.3 
 
 		 322 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  29.17 
 
 		 358 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  39.29 
 
 		 366 aa  41.2  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.97 
 
 		 340 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.03 
 
 		 346 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  29.03 
 
 		 369 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3561  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.33 
 
 		 343 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4637  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.33 
 
 		 343 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.217006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1311  oxidoreductase FAD-binding region  30.26 
 
 		 340 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.577978  normal  0.18536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2780  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  39.22 
 
 		 336 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1181  ferredoxin  38.89 
 
 		 219 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897222  normal  0.136525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.95 
 
 		 342 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.67 
 
 		 346 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0368  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.43 
 
 		 349 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000152179  unclonable  0.0000000536211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>