14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5320 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5320  OPT superfamily oligopeptide transporter  100 
 
 		 593 aa  1142    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5795  OPT superfamily oligopeptide transporter  76.22 
 
 		 634 aa  832    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  24.54 
 
 		 577 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  24.57 
 
 		 576 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  29.76 
 
 		 605 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  25.05 
 
 		 683 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  28.28 
 
 		 611 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  22.04 
 
 		 622 aa  50.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  22.99 
 
 		 668 aa  48.9  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  26.32 
 
 		 583 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  30.69 
 
 		 754 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  26.75 
 
 		 583 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  24.28 
 
 		 581 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  28.08 
 
 		 657 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>