20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2880 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2880  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 130 aa  266  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3080  4-oxalocrotonate tautomerase  72.73 
 
 		 132 aa  197  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4359  4-oxalocrotonate tautomerase  62.5 
 
 		 132 aa  171  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3464  4-oxalocrotonate tautomerase  61.72 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560795 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4924  4-oxalocrotonate tautomerase  56.15 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3847  4-oxalocrotonate tautomerase  56.15 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.544573 
 
 
-
 
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  55.04 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0717  hypothetical protein  50.77 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1150  4-oxalocrotonate tautomerase  53.54 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4629  4-oxalocrotonate tautomerase  58.87 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1169  4-oxalocrotonate tautomerase  51.97 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1769  4-oxalocrotonate tautomerase  47.69 
 
 		 135 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0159397  normal  0.0361346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4893  hypothetical protein  42.97 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3581  4-oxalocrotonate tautomerase  41.41 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3620  4-oxalocrotonate tautomerase  37.01 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3911  4-oxalocrotonate tautomerase  37.01 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  32.06 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3691  hypothetical protein  29.13 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.205332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  32.03 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2951  4-oxalocrotonate tautomerase  38.98 
 
 		 59 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>