More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2610 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  57.94 
 
 
679 aa  756    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.14 
 
 
682 aa  725    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  59.14 
 
 
678 aa  789    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  54.12 
 
 
684 aa  692    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  55.03 
 
 
680 aa  738    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  78.01 
 
 
685 aa  1090    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  100 
 
 
682 aa  1409    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  58.14 
 
 
679 aa  765    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  63.49 
 
 
714 aa  915    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  62.34 
 
 
704 aa  864    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  56.51 
 
 
690 aa  762    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  56.39 
 
 
699 aa  744    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  62.43 
 
 
692 aa  875    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  59.2 
 
 
802 aa  817    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  55.62 
 
 
680 aa  739    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  55.96 
 
 
680 aa  744    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  49.55 
 
 
645 aa  643    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  54.79 
 
 
687 aa  737    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  55.18 
 
 
738 aa  728    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  83.99 
 
 
716 aa  1195    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  55.03 
 
 
680 aa  738    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  58.16 
 
 
681 aa  751    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  57.56 
 
 
679 aa  720    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  61 
 
 
691 aa  850    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  56.07 
 
 
690 aa  751    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  56.82 
 
 
686 aa  696    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  63.3 
 
 
689 aa  914    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  62.23 
 
 
686 aa  885    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  55.52 
 
 
683 aa  713    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  54.85 
 
 
681 aa  724    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  55.03 
 
 
680 aa  738    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  55.18 
 
 
680 aa  728    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  56.66 
 
 
690 aa  763    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  56.05 
 
 
678 aa  734    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  48.66 
 
 
642 aa  622  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  47.48 
 
 
652 aa  567  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  43.84 
 
 
635 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  43.38 
 
 
635 aa  548  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  44.99 
 
 
647 aa  543  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  44.36 
 
 
647 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  45.82 
 
 
676 aa  515  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  43.99 
 
 
644 aa  497  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  56.84 
 
 
846 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  32.08 
 
 
650 aa  297  6e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  33.23 
 
 
600 aa  272  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  31.36 
 
 
587 aa  182  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  26.66 
 
 
573 aa  173  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  27.46 
 
 
583 aa  173  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.67 
 
 
577 aa  170  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  25.6 
 
 
574 aa  158  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  27.61 
 
 
576 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.61 
 
 
576 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.14 
 
 
566 aa  156  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  28.72 
 
 
539 aa  154  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.61 
 
 
566 aa  153  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  29.55 
 
 
567 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.91 
 
 
566 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.37 
 
 
597 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.63 
 
 
542 aa  148  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  27.42 
 
 
611 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  27.32 
 
 
540 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  24.16 
 
 
543 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  27.26 
 
 
545 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  27.17 
 
 
591 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  28.21 
 
 
598 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  28.93 
 
 
554 aa  144  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  28.65 
 
 
550 aa  144  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  26.27 
 
 
542 aa  143  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  26.35 
 
 
552 aa  143  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  27.64 
 
 
554 aa  140  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  26.91 
 
 
540 aa  140  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  28.15 
 
 
565 aa  140  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  26.87 
 
 
543 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  27.48 
 
 
554 aa  139  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  25.19 
 
 
700 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  23.76 
 
 
575 aa  138  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  27.08 
 
 
571 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.41 
 
 
577 aa  138  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  27.24 
 
 
556 aa  138  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.49 
 
 
577 aa  138  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  28.82 
 
 
590 aa  138  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  27.1 
 
 
584 aa  137  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  26.55 
 
 
540 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  26.55 
 
 
540 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  25.69 
 
 
538 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  26.55 
 
 
540 aa  137  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  26.61 
 
 
564 aa  136  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  25.19 
 
 
688 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  27.14 
 
 
567 aa  135  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  25.79 
 
 
552 aa  135  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  25.77 
 
 
577 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  29.1 
 
 
571 aa  135  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  27.14 
 
 
567 aa  134  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  28.14 
 
 
548 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  26.5 
 
 
561 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  27.59 
 
 
541 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  27.54 
 
 
562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  25.97 
 
 
658 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  26.98 
 
 
599 aa  132  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  26.19 
 
 
686 aa  130  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>