21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3000 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3000  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 172 aa  348  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2026  metal dependent phosphohydrolase  93.51 
 
 		 172 aa  295  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4362  metal dependent phosphohydrolase  60.54 
 
 		 169 aa  193  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0748  metal dependent phosphohydrolase  61.9 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.663055  normal  0.257153 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0181  hypothetical protein  30.71 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0583  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.07 
 
 		 704 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.496315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0538  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.97 
 
 		 727 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.533831  normal  0.300886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4348  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.22 
 
 		 728 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314297  hitchhiker  0.00562302 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.47 
 
 		 679 aa  44.7  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2586  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.37 
 
 		 727 aa  44.3  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577877  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1239  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.09 
 
 		 760 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22440  hypothetical protein  33.94 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1526  hypothetical protein  29.13 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0431553  normal  0.0979623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1138  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.4 
 
 		 699 aa  41.6  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0404  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.43 
 
 		 777 aa  41.2  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2427  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 		 192 aa  40.8  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0413  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.77 
 
 		 777 aa  41.2  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0637  hypothetical protein  31.13 
 
 		 207 aa  40.8  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.323519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.86 
 
 		 724 aa  40.8  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0726267  normal  0.258667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1501  metal dependent phosphohydrolase  35.24 
 
 		 198 aa  40.8  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0380  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.18 
 
 		 740 aa  40.8  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>