More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0241 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0241  luciferase family protein  100 
 
 
274 aa  553  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0336  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.95 
 
 
264 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  33.69 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  34.57 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  34.67 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  38.1 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  38.52 
 
 
286 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  32.68 
 
 
281 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  36.53 
 
 
285 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  36.53 
 
 
285 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  33.04 
 
 
313 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  37.26 
 
 
316 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  35.66 
 
 
285 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  32.94 
 
 
310 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  33.84 
 
 
287 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  32.16 
 
 
313 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  32.16 
 
 
313 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  36.28 
 
 
310 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  34.3 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  34.5 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  35.57 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  35.71 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  32.91 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  35.38 
 
 
308 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  31.22 
 
 
316 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  35.65 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  35.41 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  31.28 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  32.91 
 
 
309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  32.91 
 
 
309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  32.91 
 
 
309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  33.03 
 
 
322 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  32.55 
 
 
319 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  31.65 
 
 
313 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  35.89 
 
 
313 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  35.32 
 
 
337 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  34.56 
 
 
316 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.4 
 
 
311 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  35.48 
 
 
316 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.67 
 
 
310 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  40 
 
 
324 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  36.29 
 
 
336 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  33.95 
 
 
311 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  37.68 
 
 
353 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  35.41 
 
 
307 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  32.62 
 
 
322 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  34.42 
 
 
316 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.63 
 
 
339 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  34.34 
 
 
328 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.96 
 
 
287 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0395  Luciferase-like monooxygenase  33.92 
 
 
291 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  35.45 
 
 
309 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  35.18 
 
 
311 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.16 
 
 
342 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  30.62 
 
 
309 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  32.83 
 
 
328 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  30.62 
 
 
312 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  32.31 
 
 
317 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  33.01 
 
 
307 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  30.62 
 
 
309 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  34.55 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  37.21 
 
 
343 aa  99.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  31.96 
 
 
314 aa  99  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  34.57 
 
 
294 aa  99  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  31.22 
 
 
321 aa  99  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  33.98 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  33.16 
 
 
338 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  33.16 
 
 
338 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.54 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  33.16 
 
 
338 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  34.57 
 
 
327 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  35.98 
 
 
328 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12907  oxidoreductase  35.11 
 
 
325 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000227121  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  35.11 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  32.86 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  32.38 
 
 
311 aa  96.3  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.15 
 
 
328 aa  95.9  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  31.98 
 
 
330 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.86 
 
 
336 aa  95.9  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  32.07 
 
 
330 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  39.01 
 
 
371 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.33 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  34.76 
 
 
330 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  34.45 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  37.25 
 
 
372 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  32.99 
 
 
337 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  34.9 
 
 
360 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  31.58 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  38.22 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  37.11 
 
 
310 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.1 
 
 
325 aa  92.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  30.13 
 
 
335 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  32.8 
 
 
320 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  34.15 
 
 
338 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  30.6 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  34.05 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  30.89 
 
 
328 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  33.86 
 
 
330 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>