More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2654 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2654  serine protease protein  100 
 
 		 679 aa  1320    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  60.19 
 
 		 648 aa  686    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2485  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  60.64 
 
 		 650 aa  680    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0379  serine metalloprotease precursor  41.44 
 
 		 502 aa  290  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1101  serine metalloprotease  41.89 
 
 		 500 aa  281  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0573282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2709  serine metalloprotease  41.89 
 
 		 497 aa  281  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2861  serine metalloprotease  41.44 
 
 		 497 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0448584  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0341  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.44 
 
 		 627 aa  276  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.835088 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1032  peptidase MprA  38.24 
 
 		 555 aa  273  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0340  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.96 
 
 		 624 aa  271  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1078  serine metalloprotease MrpA  39.29 
 
 		 539 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.673556  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1248  serine metalloprotease MrpA  39.29 
 
 		 539 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0221  serine metalloprotease MrpA  39.29 
 
 		 539 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0493  serine metalloprotease MrpA  39.29 
 
 		 539 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179342  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2484  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.03 
 
 		 547 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2585  peptidase  39.1 
 
 		 563 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1417  serine metalloprotease MrpA  39.11 
 
 		 560 aa  269  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620558  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1343  putative serine metalloprotease  39.1 
 
 		 563 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1426  putative serine metalloprotease  39.1 
 
 		 563 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2890  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.65 
 
 		 547 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2653  putative extracellular protease signal peptide protein  37.91 
 
 		 543 aa  263  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5741  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.57 
 
 		 552 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0530598  normal  0.287024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.57 
 
 		 552 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4563  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.57 
 
 		 552 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  39.16 
 
 		 641 aa  257  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4080  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.36 
 
 		 549 aa  258  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.7 
 
 		 555 aa  257  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.923293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1283  peptidase MprA  38.78 
 
 		 550 aa  256  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3992  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.45 
 
 		 555 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.65 
 
 		 651 aa  254  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0996  peptidase MprA  39.32 
 
 		 540 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.526274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04562  extracellular protease  36.85 
 
 		 454 aa  251  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.46 
 
 		 498 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.66 
 
 		 636 aa  247  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.382458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.69 
 
 		 617 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0878069 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  36.16 
 
 		 560 aa  242  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.93 
 
 		 579 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2882  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.17 
 
 		 939 aa  237  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.52 
 
 		 693 aa  236  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3184  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.22 
 
 		 1687 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5741  serine protease, subtilase family  36.38 
 
 		 564 aa  223  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2704  serine protease  35.37 
 
 		 564 aa  221  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0794852  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0261  hypothetical protein  32.19 
 
 		 688 aa  218  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.194393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  35.2 
 
 		 771 aa  210  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03059  protease  32.55 
 
 		 620 aa  209  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1582  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.06 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.35 
 
 		 724 aa  189  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.42 
 
 		 721 aa  172  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0234  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.69 
 
 		 852 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0245  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.6 
 
 		 882 aa  167  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.983074  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.31 
 
 		 754 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0256  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.97 
 
 		 868 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0457  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.36 
 
 		 394 aa  136  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.46 
 
 		 797 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2001  hypothetical protein  36.4 
 
 		 562 aa  132  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1996  hypothetical protein  35.63 
 
 		 562 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.94 
 
 		 557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.9 
 
 		 595 aa  128  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02673  extracellular protease  50 
 
 		 170 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.2 
 
 		 587 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.35 
 
 		 601 aa  121  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.38 
 
 		 653 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4164  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.18 
 
 		 575 aa  114  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3522  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.65 
 
 		 615 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  26.62 
 
 		 576 aa  111  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.28 
 
 		 615 aa  107  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1379  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.23 
 
 		 641 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863708  normal  0.0771449 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.41 
 
 		 397 aa  106  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.69 
 
 		 589 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1096  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.69 
 
 		 589 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.2 
 
 		 639 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.92 
 
 		 479 aa  102  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  27.63 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  27.63 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  27.63 
 
 		 397 aa  101  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  27.63 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  27.63 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.61 
 
 		 298 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0553  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.71 
 
 		 440 aa  100  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000105969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1288  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.29 
 
 		 645 aa  99.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.237324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  27.87 
 
 		 397 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  27.63 
 
 		 397 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  27.63 
 
 		 397 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.25 
 
 		 1383 aa  97.4  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  27.76 
 
 		 397 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  29.31 
 
 		 298 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2796  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.51 
 
 		 856 aa  95.9  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5496  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.96 
 
 		 635 aa  95.1  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252703 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  31.76 
 
 		 399 aa  94.7  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.42 
 
 		 540 aa  94.7  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3334  hypothetical protein  29.59 
 
 		 464 aa  92  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261998  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.47 
 
 		 399 aa  92.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116357  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  28.21 
 
 		 606 aa  91.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.37 
 
 		 692 aa  91.3  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.21 
 
 		 1054 aa  91.3  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.43 
 
 		 583 aa  90.5  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.67 
 
 		 669 aa  89  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.42 
 
 		 487 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.33 
 
 		 597 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  32.3 
 
 		 533 aa  86.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>