More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2645 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  100 
 
 		 325 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  82.77 
 
 		 325 aa  544  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  82.1 
 
 		 325 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  57.78 
 
 		 311 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  54.92 
 
 		 311 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  56.83 
 
 		 329 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0706  formimidoylglutamase  48.36 
 
 		 344 aa  302  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.979825  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  54.61 
 
 		 311 aa  298  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  53.4 
 
 		 315 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  52.1 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  52.12 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  48.76 
 
 		 336 aa  285  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  47.66 
 
 		 336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  44.75 
 
 		 345 aa  278  7e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  49.23 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  45.17 
 
 		 348 aa  265  5.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  48.2 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  41.14 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  41.32 
 
 		 319 aa  255  6e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  41.32 
 
 		 319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1018  formiminoglutamase  44.06 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  49.54 
 
 		 348 aa  252  6e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  42.17 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1933  formimidoylglutamase  41.12 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.541509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  44.63 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  50.16 
 
 		 325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  49.07 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  43.34 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  48.89 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  46.86 
 
 		 317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  43.18 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  42.86 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  42.86 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  42.86 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  36.74 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  42.53 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  39.94 
 
 		 322 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  36.48 
 
 		 311 aa  189  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  34.38 
 
 		 311 aa  189  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  34.38 
 
 		 311 aa  189  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.25 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.23 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1481  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.22 
 
 		 267 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.354652 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  33.8 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  23.1 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  23.1 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  27.55 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  22.92 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  32.89 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  28.66 
 
 		 365 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  22.92 
 
 		 323 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  22.92 
 
 		 323 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  22.92 
 
 		 323 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  24.01 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  28.66 
 
 		 365 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  28.66 
 
 		 365 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  26.78 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  24.25 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  24.25 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  27.4 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  27.4 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  27.4 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  27.4 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  29.04 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  28.15 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  27.85 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  22.62 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  25.25 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4106  formiminoglutamase  29.53 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  27.68 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  28.31 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  27.81 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  27.53 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  27.05 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  27.05 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  27.05 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  27.05 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  26.95 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  26.06 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  29.97 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.8 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  26.95 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  26.95 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  26.64 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  30.18 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.21 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  26.56 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0509  putative agmatinase  30.04 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.86 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0745  agmatinase  30.45 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00217133  hitchhiker  0.00435081 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  23.51 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  27.21 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  26.9 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3869  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.31 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  26.47 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  29.27 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.92 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  26.97 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  25 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  24.41 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>