More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03928 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03928  hydrolase transmembrane protein  100 
 
 		 476 aa  963    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17350  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  39.13 
 
 		 528 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0530405  normal  0.112875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8698  amidohydrolase  30.71 
 
 		 428 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4067  amidohydrolase  30.51 
 
 		 461 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.737174  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.16 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  27.42 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  27.42 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  27.42 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  27.42 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  27.27 
 
 		 435 aa  127  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  26.86 
 
 		 439 aa  126  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  27.19 
 
 		 435 aa  126  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  27.27 
 
 		 435 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  27.27 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  30.7 
 
 		 457 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  27.19 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  27.19 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  28.98 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3159  amidohydrolase  30.93 
 
 		 447 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462314 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4132  hypothetical protein  27.76 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  23.91 
 
 		 432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.89 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  24.28 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.67 
 
 		 449 aa  118  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.67 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.77 
 
 		 484 aa  117  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.77 
 
 		 451 aa  117  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  26.86 
 
 		 466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  23.93 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  28.97 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  25.64 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  24.46 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  24.41 
 
 		 469 aa  114  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  23.61 
 
 		 468 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  24.82 
 
 		 435 aa  113  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  24.59 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4734  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.53 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3147  amidohydrolase  29.37 
 
 		 474 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171456  normal  0.0352292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.82 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3755  amidohydrolase  27.59 
 
 		 419 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.1 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  27.55 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1577  amidohydrolase  27.46 
 
 		 466 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  27.41 
 
 		 444 aa  106  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.34 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  28.37 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.71 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  22.73 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  26.29 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.25 
 
 		 459 aa  105  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  24.94 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.61 
 
 		 454 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.25 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  25.24 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.88 
 
 		 442 aa  103  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.31 
 
 		 451 aa  103  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.12 
 
 		 434 aa  103  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  26.37 
 
 		 478 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7024  amidohydrolase  25.91 
 
 		 434 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  25.67 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  27.55 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.84 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  25.93 
 
 		 656 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  28.11 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.41 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  27.09 
 
 		 663 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  26.15 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  21.93 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.64 
 
 		 476 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  26.42 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.64 
 
 		 476 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.98 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.64 
 
 		 500 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  24.3 
 
 		 462 aa  100  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.36 
 
 		 458 aa  100  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.83 
 
 		 452 aa  100  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  20.53 
 
 		 420 aa  100  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  21.53 
 
 		 428 aa  100  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.28 
 
 		 449 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  26.1 
 
 		 440 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6231  hypothetical protein  27.39 
 
 		 445 aa  99.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425385  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.69 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.28 
 
 		 449 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  26.02 
 
 		 445 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.33 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.69 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  24.5 
 
 		 431 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  28.33 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.38 
 
 		 465 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.04 
 
 		 470 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.04 
 
 		 470 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.15 
 
 		 457 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.27 
 
 		 465 aa  96.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  27.25 
 
 		 440 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  24.11 
 
 		 431 aa  96.7  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.8 
 
 		 470 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  25.93 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.08 
 
 		 470 aa  95.9  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  23.82 
 
 		 436 aa  95.9  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  25.17 
 
 		 473 aa  95.1  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>