15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3660 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3660  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  28.34 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  27.01 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  23.64 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  26.92 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  26.92 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  24.03 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  27.75 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  28.57 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  32.37 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1703  hypothetical protein  23.13 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  29.59 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  27.13 
 
 		 289 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  24.44 
 
 		 276 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1365  hypothetical protein  27.18 
 
 		 355 aa  42.7  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>