42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2190 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2190  acyltransferase 3  100 
 
 		 374 aa  745    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1540  transferase transmembrane protein  27.51 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0294492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  26.67 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  26.97 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0781  acyltransferase 3  26.37 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  25.49 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  25.95 
 
 		 397 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  27.3 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  25.95 
 
 		 397 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1009  acyltransferase 3  29.43 
 
 		 473 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0379524 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  25.55 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  25.7 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  27.08 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  30 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  26.98 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1677  acyltransferase family protein  25.71 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  26.02 
 
 		 395 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  26.02 
 
 		 395 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  29.63 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  22.44 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  25.55 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  24.74 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  33.9 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  30.26 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1645  acyltransferase family protein  26.14 
 
 		 397 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  26.08 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3700  acyltransferase family protein  25 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0274715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0507  acyltransferase 3  30.06 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  25.46 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  29.63 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  27.23 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  23.75 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  25.95 
 
 		 404 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4599  acyltransferase 3  25.66 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  24.93 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  24.91 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  27.64 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  26.63 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  23.41 
 
 		 710 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  23.41 
 
 		 710 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  27.21 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4121  acyltransferase 3  30 
 
 		 376 aa  43.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184314  normal  0.5023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>