62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1988 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1988  Xaa-Pro aminopeptidase-like  100 
 
 		 453 aa  926    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0384007  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3542  peptidase M24  59.66 
 
 		 418 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0829  peptidase M24  33.82 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0906067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2626  hydrolase/M24 family peptidase  26.33 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000124819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4527  hydrolase/M24 family peptidase  26.33 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000187713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  24.69 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1858  peptidase M24  24.76 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  25.32 
 
 		 251 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64750  methionine aminopeptidase  22.15 
 
 		 370 aa  53.5  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.991291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3457  peptidase M24  28.72 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  23.56 
 
 		 356 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  27.45 
 
 		 356 aa  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4474  peptidase M24  23.93 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2784  peptidase M24  22.76 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  24.43 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  21.27 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  22.83 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  26.8 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0928  putative aminopeptidase  22.54 
 
 		 433 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.733999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0688  peptidase M24  28.48 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142397  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  26.14 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  28 
 
 		 383 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2876  peptidase M24  28.48 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0874223  decreased coverage  0.00406602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  24.26 
 
 		 260 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  27.9 
 
 		 376 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2110  peptidase M24  22.13 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0590999  normal  0.141965 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6284  creatinase  21.91 
 
 		 403 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37554  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  22.31 
 
 		 278 aa  47  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  30.13 
 
 		 251 aa  47  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  27.39 
 
 		 376 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  27.74 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  21.14 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  21.9 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  21.9 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  25.42 
 
 		 347 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5133  peptidase M24  25.63 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  27.74 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  23.18 
 
 		 275 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0666  peptidase M24  22.83 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  27.74 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1771  peptidase M24  26.34 
 
 		 367 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0652129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  23.53 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  22.36 
 
 		 279 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3022  methionine aminopeptidase, type I  23.29 
 
 		 255 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0974756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1635  methionine aminopeptidase, type I  21.83 
 
 		 289 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.092319  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1347  methionine aminopeptidase  22.31 
 
 		 278 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000200998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3303  peptidase M24  22.1 
 
 		 418 aa  44.3  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1605  peptidase M24  23.66 
 
 		 366 aa  44.3  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  24.62 
 
 		 356 aa  43.9  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  23.08 
 
 		 261 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0969  methionine aminopeptidase, type I  29.2 
 
 		 277 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0463  peptidase M24  27.56 
 
 		 374 aa  43.9  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00525602  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  24.84 
 
 		 356 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  26.34 
 
 		 375 aa  43.5  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2548  methionine aminopeptidase  24.14 
 
 		 329 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  21.95 
 
 		 279 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  23.4 
 
 		 353 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  23.4 
 
 		 353 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2275  methionine aminopeptidase, type I  25 
 
 		 258 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  hitchhiker  0.00333924 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2597  methionine aminopeptidase type I  25.71 
 
 		 263 aa  43.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.156772  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  27.41 
 
 		 357 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  24.43 
 
 		 357 aa  43.1  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>