More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1683 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1683  flagellar basal body rod protein FlgG  100 
 
 		 262 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.082538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1506  flagellar basal body rod protein FlgG  87.02 
 
 		 262 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3787  flagellar basal body rod protein FlgG  85.5 
 
 		 262 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0961005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1383  flagellar basal body rod protein FlgG  83.59 
 
 		 262 aa  455  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4423  flagellar basal body rod protein FlgG  83.97 
 
 		 262 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1121  flagellar basal body rod protein FlgG  82.82 
 
 		 262 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5510  flagellar basal body rod protein FlgG  77.1 
 
 		 262 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  64.12 
 
 		 263 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4197  flagellar basal-body rod protein FlgG  62.6 
 
 		 263 aa  330  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0823  flagellar basal-body rod protein FlgG  61.07 
 
 		 263 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214606  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3271  flagellar basal-body rod protein FlgG  60.31 
 
 		 263 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3047  flagellar basal-body rod protein FlgG  60.31 
 
 		 263 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.517234  normal  0.668581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3245  flagellar basal-body rod protein FlgG  60.31 
 
 		 263 aa  325  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2561  flagellar basal body rod protein FlgG  53.85 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279353 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  54.23 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.18 
 
 		 260 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.76 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3476  flagellar basal body rod protein FlgG  50.77 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109253  normal  0.202824 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.69 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.55 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.15 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.85 
 
 		 263 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.69 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.98 
 
 		 260 aa  255  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  51.38 
 
 		 262 aa  254  7e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3082  flagellar basal body rod protein FlgG  50.99 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  48.46 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1431  flagellar basal body rod protein FlgG  51.15 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1558  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.85 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  47.69 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  50 
 
 		 262 aa  252  5.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  48.46 
 
 		 260 aa  252  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1421  flagellar basal body rod protein FlgG  51.38 
 
 		 262 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  48.46 
 
 		 260 aa  252  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2942  flagellar basal body rod protein FlgG  51.38 
 
 		 262 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1602  flagellar basal body rod protein FlgG  50.59 
 
 		 262 aa  251  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1166  flagellar basal body rod protein FlgG  50.99 
 
 		 262 aa  251  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3095  flagellar basal body rod protein FlgG  51.38 
 
 		 262 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  48.46 
 
 		 260 aa  251  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  48.46 
 
 		 260 aa  251  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3244  flagellar basal body rod protein FlgG  51.38 
 
 		 262 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  47.31 
 
 		 260 aa  251  9.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2957  flagellar basal body rod protein FlgG  50.99 
 
 		 262 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.711703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.29 
 
 		 260 aa  251  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  48.09 
 
 		 262 aa  250  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  50.2 
 
 		 262 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1326  flagellar basal body rod protein FlgG  50.99 
 
 		 262 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.898516  normal  0.0829972 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  48.08 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.08 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  249  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  48.08 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  48.08 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1334  flagellar basal body rod protein FlgG  50.59 
 
 		 262 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  48.08 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  48.08 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1264  flagellar basal body rod protein FlgG  50.59 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  48.08 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2987  flagellar basal body rod protein FlgG  49.62 
 
 		 261 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  48.08 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  48.08 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  48.08 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2592  flagellar basal body rod protein FlgG  50.99 
 
 		 262 aa  249  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.47 
 
 		 261 aa  249  5e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2313  flagellar basal body rod protein FlgG  50.99 
 
 		 262 aa  248  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1350  flagellar basal body rod protein FlgG  50.2 
 
 		 262 aa  248  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.85 
 
 		 261 aa  248  9e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1326  flagellar basal body rod protein FlgG  49.23 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  48.08 
 
 		 260 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.81 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.85 
 
 		 261 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  48.09 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 		 261 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  47.31 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  46.67 
 
 		 260 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.56 
 
 		 262 aa  246  4e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.54 
 
 		 260 aa  244  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  48.62 
 
 		 262 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.92 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.92 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  49.01 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  49.01 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.69 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  46.15 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1345  flagellar basal body rod protein FlgG  49.01 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3252  flagellar basal body rod protein FlgG  47.69 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.33 
 
 		 261 aa  242  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  46.18 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2960  flagellar basal body rod protein FlgG  47.31 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.24 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2605  flagellar basal body rod protein FlgG  47.69 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.772523  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.59 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  48.26 
 
 		 262 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  49.03 
 
 		 262 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4193  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2965  flagellar basal body rod protein FlgG  47.67 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  48.65 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3653  flagellar basal body rod protein FlgG  48.06 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.24 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  47.89 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  47.89 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>