More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0965 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0859  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  86.02 
 
 		 377 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0965  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 376 aa  743    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5196  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  79.13 
 
 		 373 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0708  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  76.28 
 
 		 381 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  0.208923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2078  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  61.9 
 
 		 365 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.846917 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4315  hypothetical protein  59.33 
 
 		 362 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1358  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  52.07 
 
 		 374 aa  325  8.000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1183  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.83 
 
 		 362 aa  309  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286566  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2041  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.6 
 
 		 356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  47.78 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1285  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  49.72 
 
 		 362 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2472  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50.72 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1518  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.71 
 
 		 376 aa  299  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3126  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50.14 
 
 		 364 aa  296  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2943  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  45.86 
 
 		 359 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01280  ABC transporter, membrane spanning protein  48.31 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3830  molybdate ABC transporter ATPase  48.86 
 
 		 363 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1940  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.86 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.885935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3547  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0186  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2886  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.17 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224709  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2975  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 		 362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0469228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1570  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.56 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.849947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3429  molybdenum transporter  46.13 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1380  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.33894  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3545  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.73 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0341777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2758  ABC transporter:TOBE  46.29 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394387  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40420  molybdenum transport protein ModC  45.3 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2860  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  47.85 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2847  Fis family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.801807  normal  0.896227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3199  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.16 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.951869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4341  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.43 
 
 		 374 aa  276  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.884893 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2784  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 359 aa  276  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000880352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0538  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.86 
 
 		 382 aa  270  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2026  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.04 
 
 		 369 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  44.66 
 
 		 355 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0977  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.83 
 
 		 379 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2667  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.69 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0993719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3880  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314115  decreased coverage  0.00984217 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3869  ABC molybdate transporter, ATPase subunit ModC  46.03 
 
 		 368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340875  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01580  ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4171  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.75 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00841959  normal  0.195843 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03849  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 352 aa  236  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0663  molybdate transporter ATP-binding protein  40.76 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3483  molybdenum import ATP-binding protein modC  43.63 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0741  molybdate transporter ATP-binding protein  39.24 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3865  molybdate transporter ATP-binding protein  38.69 
 
 		 361 aa  232  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 370 aa  233  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0821  molybdate transporter ATP-binding protein  38.19 
 
 		 361 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0767  molybdate transporter ATP-binding protein  38.15 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05727  molybdate transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3197  molybdate transporter ATP-binding protein  38.15 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0432281  hitchhiker  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3540  molybdate transporter ATP-binding protein  37.53 
 
 		 361 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0828  molybdate transporter ATP-binding protein  37.91 
 
 		 361 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216201  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3711  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.22 
 
 		 358 aa  227  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0796  molybdate transporter ATP-binding protein  37.91 
 
 		 361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3063  molybdate transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1179  molybdate transporter ATP-binding protein  37.91 
 
 		 352 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4252  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0264287  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2880  molybdate transporter ATP-binding protein  39.23 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1305  molybdate transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1925  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1271  molybdate transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 		 352 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2823  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 		 357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.623728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0060  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 		 362 aa  223  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.400858 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0090  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.508509  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5516  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.22 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.929695 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2935  molybdate transporter ATP-binding protein  38.8 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1421  molybdate transporter ATP-binding protein  38.8 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000119  molybdenum transport ATP-binding protein ModC  38.75 
 
 		 368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40487  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2468  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 354 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196749 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2848  molybdate transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.91 
 
 		 367 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1581  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50.2 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2675  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  40.92 
 
 		 364 aa  212  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2328  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.35 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2720  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.95 
 
 		 357 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118239  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0780  molybdate transporter ATP-binding protein  35.34 
 
 		 363 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.204201  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3715  ABC type ATPase  44.03 
 
 		 376 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0807  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.23 
 
 		 369 aa  206  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3727  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.13 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2541  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.8 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3635  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.17 
 
 		 364 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3662  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  41.34 
 
 		 363 aa  202  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1629  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.09 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3918  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.5 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0910  molybdate transporter ATP-binding protein  37.16 
 
 		 352 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2611  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.05 
 
 		 351 aa  193  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0847  molybdate transporter ATP-binding protein  37.16 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0933  molybdate transporter ATP-binding protein  37.16 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.295705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0878  molybdate transporter ATP-binding protein  37.16 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0819  molybdate transporter ATP-binding protein  37.16 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2877  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.89 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0868  molybdate transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.661527  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0686  molybdate transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.066647  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2897  molybdate transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000164912  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0792  molybdate transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0819  molybdate transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0788  molybdate transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>