30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3148 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3148  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.03875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2132  hypothetical protein  92.59 
 
 		 81 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3291  hypothetical protein  92.59 
 
 		 81 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.641744  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3919  hypothetical protein  91.36 
 
 		 81 aa  156  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2583  hypothetical protein  87.65 
 
 		 81 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5236  hypothetical protein  88.46 
 
 		 80 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2181  hypothetical protein  82.72 
 
 		 81 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7506  hypothetical protein  66.25 
 
 		 85 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2161  hypothetical protein  65.43 
 
 		 84 aa  120  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.726744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2481  hypothetical protein  65 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2204  hypothetical protein  65 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  0.887365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2545  hypothetical protein  66.67 
 
 		 84 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0741  hypothetical protein  66.67 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3232  hypothetical protein  65.43 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0747  hypothetical protein  66.67 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6759  hypothetical protein  63.75 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138276  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0587  hypothetical protein  65.38 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1118  hypothetical protein  64.2 
 
 		 81 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2547  hypothetical protein  58.02 
 
 		 81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1566  hypothetical protein  55.56 
 
 		 81 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1763  hypothetical protein  55.56 
 
 		 81 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.668208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1111  hypothetical protein  56.79 
 
 		 81 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0983  hypothetical protein  59.21 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0184566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0924  hypothetical protein  59.74 
 
 		 86 aa  100  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929821  normal  0.30191 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0870  hypothetical protein  58.67 
 
 		 82 aa  99  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111601  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2605  hypothetical protein  58.9 
 
 		 87 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1505  hypothetical protein  35.85 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0566  hypothetical protein  42.86 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0492  hypothetical protein  41.82 
 
 		 64 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0487  hypothetical protein  43.86 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>