22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2263 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2263  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  190  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  52.94 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  47.83 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  47.78 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2437  hypothetical protein  51.61 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  48.39 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  43.33 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  32.58 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  33.72 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  34.12 
 
 		 83 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  36.9 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  39.08 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  32 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  32.53 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  36.78 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  36.78 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  35 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  31.17 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>