25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0815 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  68.42 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  65.81 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  57.72 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  58.06 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0681  hypothetical protein  66.06 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  55.74 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  46.09 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  47.52 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  46.88 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2349  hypothetical protein  47.92 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2306  protein of unknown function DUF423  48.31 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.454103  normal  0.0930723 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2331  hypothetical protein  42.24 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5379  protein of unknown function DUF423  48.08 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3011  protein of unknown function DUF423  58.82 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  41.28 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3262  protein of unknown function DUF423  50 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.319272 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  41.59 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  44.44 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  41.59 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5083  hypothetical protein  47.95 
 
 		 134 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225516  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1480  hypothetical protein  41.88 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3298  protein of unknown function DUF423  49.02 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00419882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5332  hypothetical protein  36.07 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.423162  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1612  membrane protein DUF423  30.91 
 
 		 137 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.221104  normal  0.524793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>