29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2931 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2931  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2538  hypothetical protein  76.92 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  62.2 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4053  hypothetical protein  56.96 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  53.61 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  68.97 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  76.09 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  50.62 
 
 		 109 aa  57  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  50.62 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  53.33 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  50.62 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  48.24 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  52.5 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  43.48 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4814  pentapeptide MXKDX repeat protein  49.3 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  58.62 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.565445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1517  hypothetical protein  51.39 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  47.06 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0020  hypothetical protein  45.07 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0017  hypothetical protein  45.33 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0198  hypothetical protein  44.29 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2843  hypothetical protein  43.84 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0483  hypothetical protein  47.95 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1402  hypothetical protein  47.95 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1397  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  47.95 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0669  hypothetical protein  47.95 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.664868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1198  hypothetical protein  47.95 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0725407  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1530  hypothetical protein  47.95 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  60.87 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>