29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0681 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0681  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  220  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  77.87 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  79.51 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  65.29 
 
 		 125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  61.48 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  55.46 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  52.59 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2331  hypothetical protein  42.98 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  49.06 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  51.69 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  46.88 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  45.13 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2306  protein of unknown function DUF423  46.88 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.454103  normal  0.0930723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2349  hypothetical protein  46.88 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  43.24 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  43.24 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  44.32 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5083  hypothetical protein  52.86 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225516  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5379  protein of unknown function DUF423  47.57 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1612  membrane protein DUF423  34.86 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.221104  normal  0.524793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3298  protein of unknown function DUF423  54.17 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00419882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3011  protein of unknown function DUF423  50 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3262  protein of unknown function DUF423  48.98 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.319272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1480  hypothetical protein  42.62 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0359  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5156  hypothetical protein  34.17 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444342  normal  0.879938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4979  hypothetical protein  34.17 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5106  hypothetical protein  34.17 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.167348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0692  membrane protein  30.58 
 
 		 128 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.874009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>