60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1372 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1372  hypothetical protein  100 
 
 		 589 aa  1229    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.438786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4665  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.3 
 
 		 542 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2212  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  21.88 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5142  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.66 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6934  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.89 
 
 		 596 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9116  molybdopterin biosynthesis protein  30.32 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.78 
 
 		 580 aa  64.3  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.329813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4482  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.34 
 
 		 592 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4354  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.35 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0356  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.34 
 
 		 771 aa  57.4  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.952881  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.67 
 
 		 604 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.67 
 
 		 604 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.67 
 
 		 604 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.58 
 
 		 264 aa  53.9  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.35 
 
 		 635 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152848  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  30.22 
 
 		 249 aa  52.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2047  ThiF family protein  26.86 
 
 		 601 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0134  ThiF family protein  23.99 
 
 		 594 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13900  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  21.34 
 
 		 550 aa  50.8  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  39.29 
 
 		 272 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1158  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  23.72 
 
 		 264 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0720716  normal  0.0953853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3675  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  25.22 
 
 		 338 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1233  molybdopterin biosynthesis protein  35.85 
 
 		 269 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5993  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.19 
 
 		 586 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2344  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.95 
 
 		 591 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.8 
 
 		 253 aa  48.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000172262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4541  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  32.71 
 
 		 339 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.43862 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.28 
 
 		 254 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.51 
 
 		 244 aa  47.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0649  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  33.64 
 
 		 339 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3275  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  25.73 
 
 		 338 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.649383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3582  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  24.35 
 
 		 338 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.75 
 
 		 598 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1642  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  24.78 
 
 		 338 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.97 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3592  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  25.22 
 
 		 338 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.69 
 
 		 390 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0803  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  33.64 
 
 		 339 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.793608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0790  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  31.78 
 
 		 339 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3575  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  25.31 
 
 		 338 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.22 
 
 		 266 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  40.85 
 
 		 252 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1270  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.25 
 
 		 248 aa  45.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  28.91 
 
 		 390 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0887  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  32.73 
 
 		 339 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.43 
 
 		 266 aa  45.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1138  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.21 
 
 		 213 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.21 
 
 		 267 aa  45.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3325  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  25.31 
 
 		 338 aa  45.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1149  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.93 
 
 		 265 aa  44.7  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000110097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  30.72 
 
 		 272 aa  44.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.93 
 
 		 267 aa  44.7  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3624  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  25.31 
 
 		 338 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.54 
 
 		 258 aa  44.3  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3361  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  25.31 
 
 		 338 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.85 
 
 		 268 aa  44.3  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1858  thiF protein, putative  31.01 
 
 		 250 aa  43.9  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0810  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  32.73 
 
 		 339 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.48292e-47 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0620  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  32.76 
 
 		 339 aa  43.9  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.27 
 
 		 390 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>