42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2047 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2047  ThiF family protein  100 
 
 		 601 aa  1222    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0356  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.7 
 
 		 771 aa  276  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.952881  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6934  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.13 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1372  hypothetical protein  26.86 
 
 		 589 aa  57.8  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.438786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4482  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.14 
 
 		 592 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.83 
 
 		 635 aa  55.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152848  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0663  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  21.91 
 
 		 463 aa  54.7  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00852937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2344  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.15 
 
 		 591 aa  51.2  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1158  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.72 
 
 		 201 aa  50.8  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00601178  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1233  molybdopterin biosynthesis protein  28.33 
 
 		 269 aa  50.4  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33774  ubiquitin-activating enzyme E1, protein 3  36.99 
 
 		 462 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31 
 
 		 580 aa  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.329813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1158  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.64 
 
 		 264 aa  48.1  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0720716  normal  0.0953853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0134  ThiF family protein  30.3 
 
 		 594 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0371  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.59 
 
 		 203 aa  47.8  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.41 
 
 		 277 aa  47.4  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0542  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.25 
 
 		 264 aa  47.4  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.98 
 
 		 246 aa  47  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000441041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5993  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.02 
 
 		 586 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0130  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.32 
 
 		 257 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9116  molybdopterin biosynthesis protein  41.54 
 
 		 293 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1659  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.78 
 
 		 200 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2437  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.72 
 
 		 306 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2321  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.72 
 
 		 306 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.58316  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1178  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.37 
 
 		 267 aa  46.2  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4354  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.44 
 
 		 575 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54676  Ubiquitin--protein ligase molybdopterin-converting factor  26.01 
 
 		 437 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0728  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.34 
 
 		 247 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.33 
 
 		 207 aa  44.7  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0649  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  32.65 
 
 		 339 aa  44.3  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.22 
 
 		 389 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2005  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.65 
 
 		 249 aa  43.9  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19210  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  28.24 
 
 		 413 aa  43.9  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0193434  normal  0.0109751 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1141  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.67 
 
 		 266 aa  43.9  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.158288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2212  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.74 
 
 		 576 aa  43.9  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3693  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.92 
 
 		 259 aa  43.9  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.797149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.05 
 
 		 393 aa  43.9  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.64 
 
 		 386 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2301  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.41 
 
 		 334 aa  43.5  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2343  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.41 
 
 		 334 aa  43.5  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  34.38 
 
 		 252 aa  43.5  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.15 
 
 		 598 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>