75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1283 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  100 
 
 		 165 aa  312  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  95.76 
 
 		 165 aa  304  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  53.37 
 
 		 183 aa  168  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  32.88 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  31.16 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0733  Colicin V production protein  30.94 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.018844  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  30.06 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  30.14 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  30.14 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  30.14 
 
 		 185 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  30.14 
 
 		 185 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  31.51 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  31.51 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  29.93 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  31.51 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  32.35 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  32.35 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  32.35 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  28.77 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  26.14 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  28.86 
 
 		 195 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  27.63 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3794  colicin V production protein  27.91 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  30.41 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  26 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  26.57 
 
 		 248 aa  48.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  30.15 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  27.94 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  28.83 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  32.86 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  25.9 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  30.49 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4988  Colicin V production protein  26.49 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.011755 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  30.14 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1266  colicin V production protein  27.66 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.488094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  27.89 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  30.15 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  30.15 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2879  Colicin V production protein  27.34 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.111961 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  26.11 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  27.13 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  28.22 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  30.41 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  27.74 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  25.32 
 
 		 190 aa  44.7  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3760  Colicin V production protein  30.53 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1909  colicin V production protein  29.75 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.485501 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0875  colicin V production protein  25.68 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.592724  normal  0.0357413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0984  colicin V production protein  29.36 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769176  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1687  colicin V production protein  33.33 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  24.84 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  29.2 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1241  colicin V production protein  27.4 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.599135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0404  colicin V production protein  27.03 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  28.47 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  31.9 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  29.41 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  28.57 
 
 		 165 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  28.57 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1211  hypothetical protein  26.53 
 
 		 171 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.299542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  28.57 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  28.57 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  28.87 
 
 		 206 aa  41.6  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  28.57 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  28.57 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  28.57 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  26.47 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  28.67 
 
 		 218 aa  41.2  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  26.35 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1901  colicin V production protein  27.69 
 
 		 186 aa  41.2  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  28.81 
 
 		 177 aa  40.8  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  27.07 
 
 		 193 aa  40.8  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  27.74 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  28.57 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  28.57 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>