20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0458 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0458  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  320  4e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74928 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3168  HK97 family phage protein  34.72 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00719804 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3391  HK97 family phage protein  35.29 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  hitchhiker  0.00000000275201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1571  hypothetical protein  27.89 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88517  hitchhiker  0.0039923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4109  HK97 family phage protein  25.85 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2958  hypothetical protein  26.62 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3871  HK97 family phage protein  27.33 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557276  normal  0.0333668 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1684  HK97 family phage protein  26.85 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2479  phage protein, HK97 gp10 family  45.45 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119601  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1051  HK97 family phage protein  26.53 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.325437  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1640  hypothetical protein  30.72 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2588  phage protein, HK97 gp10 family  25.16 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.741873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1343  HK97 family phage protein  25.34 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.381849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1193  HK97 family phage protein  42.22 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000986057 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1544  phage protein, HK97 gp10 family  37.78 
 
 		 148 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0566453 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2178  phage protein, HK97 gp10 family  37.78 
 
 		 148 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248961 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2242  phage protein, HK97 gp10 family  37.78 
 
 		 148 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000544361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2888  phage protein, HK97 gp10 family  37.78 
 
 		 148 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0931  phage protein, HK97 gp10 family  37.78 
 
 		 148 aa  42  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2627  phage protein, HK97 gp10 family  27.27 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>