15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0452 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0452  pore-forming tail tip protein  100 
 
 		 1023 aa  2059    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102086  normal  0.725254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1577  lambda family phage tail tape measure protein  46.27 
 
 		 813 aa  241  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.017316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4103  hypothetical protein  41.69 
 
 		 814 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1636  lambda family phage tail tape measure protein  43.31 
 
 		 1668 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3328  hypothetical protein  37.8 
 
 		 1632 aa  189  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.053568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2059  phage tail tape measure protein  42.52 
 
 		 1673 aa  188  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  39.68 
 
 		 853 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.179371 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  44.98 
 
 		 820 aa  180  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0634  hypothetical protein  51.41 
 
 		 691 aa  158  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.486011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2994  hypothetical protein  32.51 
 
 		 717 aa  94  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3036  peptidase M23B  34.34 
 
 		 1155 aa  53.9  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  25.76 
 
 		 669 aa  48.5  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1152  hypothetical protein  31.19 
 
 		 763 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  47.22 
 
 		 1120 aa  45.1  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1230  hypothetical protein  25.13 
 
 		 726 aa  45.1  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.909152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>