252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0118 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0118  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  664    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0127  hypothetical protein  94.06 
 
 		 320 aa  627  1e-179  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2129  hypothetical protein  64.19 
 
 		 315 aa  402  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0854  hypothetical protein  43.92 
 
 		 285 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57970  hypothetical protein  43.92 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5038  hypothetical protein  43.92 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4266  hypothetical protein  44.11 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3181  hypothetical protein  43.1 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2718  hypothetical protein  41.16 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  41.41 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0988  hypothetical protein  42.23 
 
 		 284 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0949  hypothetical protein  42.23 
 
 		 284 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  44.16 
 
 		 286 aa  232  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12760  hypothetical protein  42.23 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4456  hypothetical protein  41.89 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0867  hypothetical protein  40.94 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0723  hypothetical protein  41.69 
 
 		 282 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13975 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0486  hypothetical protein  40.94 
 
 		 284 aa  229  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03196  hypothetical protein  41.16 
 
 		 281 aa  228  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002400  hypothetical ATP-binding protein UPF0042 contains P-loop  42.81 
 
 		 287 aa  228  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2233  hypothetical protein  42.28 
 
 		 288 aa  228  8e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4150  hypothetical protein  41.89 
 
 		 285 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0739  hypothetical protein  40.88 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0956  hypothetical protein  42.09 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.149336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3314  hypothetical protein  41.14 
 
 		 282 aa  226  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.304196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3352  hypothetical protein  40.94 
 
 		 284 aa  225  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00592419  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3964  hypothetical protein  40.94 
 
 		 284 aa  225  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0669  hypothetical protein  40.94 
 
 		 284 aa  225  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  normal  0.167586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0670  hypothetical protein  40.68 
 
 		 284 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4243  hypothetical protein  41.47 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220847  hitchhiker  0.000000309991 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3641  hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.564975  normal  0.148775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03070  hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0502  conserved hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3584  hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3620  hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.167343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3693  hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3513  hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3501  hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0495  hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.469234  normal  0.256599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4527  hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3398  hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3682  hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3565  hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3515  hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03021  hypothetical protein  41.24 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0495  hypothetical protein  40.94 
 
 		 284 aa  223  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.159848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3671  hypothetical protein  41.02 
 
 		 284 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000686834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0704  hypothetical protein  41.02 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.253725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0683  hypothetical protein  41.02 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0700496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0713  hypothetical protein  41.02 
 
 		 284 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0521342  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  41.02 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0278  hypothetical protein  40.21 
 
 		 285 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.532116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0271  hypothetical protein  40.21 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3380  hypothetical protein  40.14 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4370  hypothetical protein  39.86 
 
 		 284 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.473818  normal  0.781233 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1178  hypothetical protein  39.6 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0722  hypothetical protein  41.55 
 
 		 286 aa  218  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1156  hypothetical protein  40.55 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0502  hypothetical protein  40.55 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0438  hypothetical protein  40.55 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2797  hypothetical protein  40.14 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0712  hypothetical protein  40.86 
 
 		 284 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000213655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1006  hypothetical protein  40.41 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0782476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3818  hypothetical protein  40.55 
 
 		 284 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.564753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2229  hypothetical protein  40.68 
 
 		 298 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03667  hypothetical protein  43.43 
 
 		 287 aa  215  7e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4546  hypothetical protein  40.14 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.820561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1124  hypothetical protein  40.07 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.974535  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0374  hypothetical protein  43.14 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.137383 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02223  hypothetical protein  39.73 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.470659  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0297  hypothetical protein  39.2 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  41.41 
 
 		 287 aa  209  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3091  hypothetical protein  39.32 
 
 		 283 aa  208  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.279163  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4126  hypothetical protein  40.88 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0145  hypothetical protein  39.78 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0950  hypothetical protein  40.22 
 
 		 294 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0482  hypothetical protein  40.14 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3336  hypothetical protein  40.44 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0350  hypothetical protein  40 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0771  hypothetical protein  38.91 
 
 		 299 aa  206  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0495801  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0592  hypothetical protein  40.82 
 
 		 297 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178282  hitchhiker  0.00532801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0403  hypothetical protein  38.08 
 
 		 296 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.7432  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3112  hypothetical protein  39.8 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0761  hypothetical protein  39.8 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0258  hypothetical protein  39.79 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0080  hypothetical protein  39.8 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1510  hypothetical protein  39.8 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.782325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0577  hypothetical protein  39.8 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0593  hypothetical protein  39.8 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2938  hypothetical protein  39.8 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3021  ATPase  39.8 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2629  hypothetical protein  39.8 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.697513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2806  hypothetical protein  39.12 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.724657 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2181  hypothetical protein  39.12 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0277901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2795  hypothetical protein  39.12 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540439  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0746  hypothetical protein  40.27 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0322  hypothetical protein  39.8 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0125  hypothetical protein  38.98 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2713  hypothetical protein  39.46 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2855  hypothetical protein  39.46 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.801383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>