106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0935 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  100 
 
 		 183 aa  354  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  55.21 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  53.37 
 
 		 165 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  33.56 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  31.85 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  28.41 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0960  colicin V production protein  29.8 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0660005  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1051  colicin V production protein  29.8 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  31.58 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  31.15 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1266  colicin V production protein  26.32 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.488094  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  30.77 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  31.43 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  27.52 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  29.94 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  28.77 
 
 		 166 aa  52  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  31.43 
 
 		 162 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  31.43 
 
 		 162 aa  51.2  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  25.6 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  28.97 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  28.1 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  28.1 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  28.97 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  31.72 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  30.71 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  30.71 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  28.17 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  30.6 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  31.58 
 
 		 238 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0984  colicin V production protein  30 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  27.78 
 
 		 248 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  31.16 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  25.13 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  32.14 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  32.14 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  32.14 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  33.02 
 
 		 162 aa  48.5  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  32.14 
 
 		 162 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  29.1 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  28.74 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3940  colicin V production protein  30.51 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  33.63 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  27.22 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1687  colicin V production protein  35.9 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  32.85 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  25.64 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  27.74 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1799  colicin V production protein  29.61 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  32.14 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1024  colicin V production protein  22.37 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0900  colicin V production protein  22.37 
 
 		 217 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  25 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3760  Colicin V production protein  28.15 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1241  colicin V production protein  30 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.599135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  29.29 
 
 		 162 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0875  colicin V production protein  28.99 
 
 		 163 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.592724  normal  0.0357413 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  22.22 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3794  colicin V production protein  26.27 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  29.29 
 
 		 162 aa  45.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  30.71 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  24.49 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  26.79 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  25 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  28.99 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  24.68 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  27.49 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  28.28 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  26.9 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  25 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  27.19 
 
 		 191 aa  44.3  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  28.28 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  23.03 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1909  colicin V production protein  32.5 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.485501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2259  colicin V production protein  29.41 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00673398  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  32.67 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  29.25 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0733  Colicin V production protein  30.51 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.018844  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  32.67 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  23.03 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  26.43 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  28.68 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  28.91 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0404  colicin V production protein  23.87 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  29.08 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1901  colicin V production protein  28.68 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  34.65 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  33.66 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  33.66 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  28.76 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  33.66 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  21.28 
 
 		 189 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  26.15 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  26.15 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  26.15 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0414  Colicin V production protein  25.44 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.728843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1211  hypothetical protein  28.18 
 
 		 171 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.299542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1500  colicin V production protein  24.74 
 
 		 199 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0129  membrane protein CvpA, putative  24.14 
 
 		 196 aa  41.6  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.058893  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1785  colicin V production protein  27.5 
 
 		 207 aa  42  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.170102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  22 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>