53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0933 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0933  membrane protein-like protein  100 
 
 		 178 aa  360  5.0000000000000005e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1100  putative transmembrane protein  62.69 
 
 		 149 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.664506  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  34.78 
 
 		 118 aa  84.7  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  31.9 
 
 		 129 aa  84.7  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  31.9 
 
 		 129 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  31.9 
 
 		 129 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  31.9 
 
 		 129 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  31.9 
 
 		 129 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  31.9 
 
 		 129 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  31.9 
 
 		 129 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  31.9 
 
 		 129 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  35.04 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  34.88 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  30.22 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  30.07 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  34.07 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  34.88 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  31.11 
 
 		 130 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  35.56 
 
 		 122 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  29.46 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  29.46 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  29.46 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  28.28 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  36.67 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  29.08 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  31.01 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0419  hypothetical protein  25.81 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644826 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  30 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0827  hypothetical protein  24.67 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  28.81 
 
 		 115 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  29.41 
 
 		 121 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  30 
 
 		 121 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  28.57 
 
 		 121 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  34.78 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  32.73 
 
 		 112 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  30.3 
 
 		 125 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  25.53 
 
 		 128 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0839  hypothetical protein  27.34 
 
 		 125 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0778  putative transmembrane protein  27.46 
 
 		 128 aa  44.7  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0879  membrane protein-like protein  29.51 
 
 		 134 aa  44.7  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1178  putative transmembrane protein  26.35 
 
 		 129 aa  44.3  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0741  putative transmembrane protein  26.76 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0778968  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2514  membrane protein-like  25 
 
 		 126 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.607723  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3097  hypothetical protein  28.1 
 
 		 122 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1050  putative transmembrane protein  24.65 
 
 		 128 aa  42.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  26.72 
 
 		 122 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0812  membrane protein-like  21.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4348  hypothetical protein  30.95 
 
 		 137 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67611  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1785  membrane protein-like  21.21 
 
 		 128 aa  40.8  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>