48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0722 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  100 
 
 		 304 aa  630  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  58.36 
 
 		 298 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  51.5 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  49.31 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  50.75 
 
 		 299 aa  295  8e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  48.03 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  44.49 
 
 		 299 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  47.45 
 
 		 257 aa  248  9e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  43.13 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  45.17 
 
 		 259 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  41.34 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  36.7 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  36.4 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  36.4 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  38.61 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  37.16 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  30.3 
 
 		 250 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 255 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  27 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  24.39 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  28.14 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  26.14 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  28.5 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  29.15 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  28.14 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  24.9 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  23.88 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  25.54 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  24.4 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  27.78 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  22.76 
 
 		 227 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  22.22 
 
 		 227 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  22.05 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  31.73 
 
 		 340 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  22.68 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.89 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  24.45 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5695  metal-dependent hydrolase  25.71 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  31.63 
 
 		 277 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  24.17 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  24.79 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  22.33 
 
 		 201 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.74 
 
 		 590 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  23.08 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.13 
 
 		 259 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  22.46 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>