48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4619 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4619  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  100 
 
 		 436 aa  892    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000187053  hitchhiker  0.0000000628519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  62.41 
 
 		 424 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  62.23 
 
 		 418 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  56.14 
 
 		 435 aa  471  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  56.28 
 
 		 431 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  54.33 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1981  hypothetical protein  45.04 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51853  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  44.53 
 
 		 422 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  40.8 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  35.42 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  35.76 
 
 		 436 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  31.04 
 
 		 438 aa  205  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  33.33 
 
 		 428 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  29.97 
 
 		 416 aa  190  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  0.0000000111615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  37.31 
 
 		 273 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  27.78 
 
 		 443 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  29.03 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  30 
 
 		 288 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  29.41 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4531  hypothetical protein  32.45 
 
 		 267 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.814257  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  30.37 
 
 		 426 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1011  5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.43 
 
 		 460 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000144218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0993  hypothetical protein  25.3 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3270  hypothetical protein  26.62 
 
 		 453 aa  96.7  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0179938  normal  0.335413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3470  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  23.28 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00801853  normal  0.511219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0350  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  27.61 
 
 		 687 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1299  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  24.66 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217939  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1386  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.66 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0863  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.51 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1703  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.38 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0806  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  21.93 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0894928  hitchhiker  0.000053751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2402  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.42 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3197  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.23 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0398257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6960  hypothetical protein  25.11 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00920086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0976  hypothetical protein  27.39 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0362174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05460  McrBC 5-methylcytosine restriction system component  27.82 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0227  hypothetical protein  23 
 
 		 514 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0395217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0026  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  23.91 
 
 		 334 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.579056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0437  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  39.06 
 
 		 164 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  hitchhiker  0.00000000000258291 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04175  hypothetical protein  20.66 
 
 		 348 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04211  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrC  20.66 
 
 		 348 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3652  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  20.66 
 
 		 348 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3300  5-methylcytosine restriction system component- like protein  25.91 
 
 		 398 aa  50.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0952  hypothetical protein  23.94 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1353  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  26.03 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7821  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.94 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1213  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  22.03 
 
 		 351 aa  43.5  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.816052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3582  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  21.09 
 
 		 405 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>