14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3824 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3824  fimbrial protein-like protein  100 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1501  fimbrial protein  40.76 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1466  fimbrial protein  35.22 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2230  type I pilus biogensis protein FimA  38.89 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2039  fimbrial protein  35.52 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330404  normal  0.373612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1891  type 1 pili subunit FimI  33.33 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  26.88 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  26.88 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  26.88 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  26.88 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  27.46 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  26.74 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  29.59 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3518  fimbrial protein  26.9 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00642189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>