14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3824 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_3824  fimbrial protein-like protein  100 
 
 
208 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1501  fimbrial protein  40.76 
 
 
181 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1466  fimbrial protein  35.22 
 
 
158 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2230  type I pilus biogensis protein FimA  38.89 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2039  fimbrial protein  35.52 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330404  normal  0.373612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1891  type 1 pili subunit FimI  33.33 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  26.88 
 
 
181 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  26.88 
 
 
181 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  26.88 
 
 
181 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  26.88 
 
 
181 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  27.46 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  26.74 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  29.59 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3518  fimbrial protein  26.9 
 
 
197 aa  42.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00642189  normal 
 
 
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