20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3667 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3388  hypothetical protein  88.54 
 
 
890 aa  1504    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2555  hypothetical protein  83.43 
 
 
893 aa  1454    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0784623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3667  hypothetical protein  100 
 
 
890 aa  1823    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2369  hypothetical protein  91.69 
 
 
890 aa  1563    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2076  hypothetical protein  90.67 
 
 
907 aa  1604    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  26.36 
 
 
887 aa  263  8.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  25.05 
 
 
875 aa  71.6  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00498  hypothetical protein  22.57 
 
 
780 aa  65.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10002  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  22.03 
 
 
852 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  21.54 
 
 
893 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  21.9 
 
 
944 aa  55.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  21.27 
 
 
862 aa  55.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  20.71 
 
 
949 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  21.7 
 
 
945 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  22.4 
 
 
856 aa  52.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00492  hypothetical protein  21.43 
 
 
770 aa  50.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.998785  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  23.23 
 
 
1160 aa  48.1  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  20.34 
 
 
944 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  21.39 
 
 
944 aa  47.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2245  hypothetical protein  35.85 
 
 
62 aa  46.2  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>