29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3572 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3572    100 
 
 		 291 bp  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  89.49 
 
 		 1197 bp  317  9e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4525  IS256 family transposase  86.46 
 
 		 195 bp  174  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5004    83.58 
 
 		 477 bp  91.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0511261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  83.74 
 
 		 1200 bp  85.7  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  83.74 
 
 		 1200 bp  85.7  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3616  transposase  89.23 
 
 		 288 bp  73.8  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  90.57 
 
 		 1200 bp  65.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  90.57 
 
 		 1200 bp  65.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  90.57 
 
 		 1200 bp  65.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2280    84.72 
 
 		 694 bp  56  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    81.48 
 
 		 228 bp  56  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    90.91 
 
 		 723 bp  56  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    94.29 
 
 		 1184 bp  54  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  96.55 
 
 		 1200 bp  50.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  96.55 
 
 		 1200 bp  50.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1076  transposase mutator type  91.67 
 
 		 1179 bp  48.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0982723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  91.43 
 
 		 927 bp  46.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  91.43 
 
 		 1200 bp  46.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  91.43 
 
 		 1200 bp  46.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1314  hypothetical protein  100 
 
 		 1011 bp  46.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  80.81 
 
 		 1197 bp  46.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  80.81 
 
 		 1197 bp  46.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  80.81 
 
 		 1197 bp  46.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  80.81 
 
 		 1197 bp  46.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3245    80.81 
 
 		 2780 bp  46.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.884067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  80.81 
 
 		 1197 bp  46.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  79.67 
 
 		 1200 bp  46.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  91.43 
 
 		 927 bp  46.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>