39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1567 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1567  Urea transporter  100 
 
 		 290 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0796625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4302  Urea transporter  87.24 
 
 		 291 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3867  Urea transporter  89.04 
 
 		 292 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.464169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3627  Urea transporter  90.72 
 
 		 291 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.075407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1593  Urea transporter  55.89 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0322778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3629  Urea transporter-like protein  81.82 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2774  Urea transporter  43.36 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131823  normal  0.29539 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4315  putative urea transporter  32.49 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0682  Urea transporter  31 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4829  Urea transporter  26.84 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1138  urea transporter  30.15 
 
 		 330 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.138675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3561  urea transporter  30.15 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.493557  normal  0.0101764 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1084  urea transporter  30.15 
 
 		 330 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1892  Urea transporter  28.67 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0862961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3835  putative transporter  39.02 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1794  Urea transporter  30.97 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4874  Urea transporter  31.06 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0687678  normal  0.634987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45060  putative transporter  38.99 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3367  Urea transporter  31.09 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000898038  hitchhiker  0.0000000000000178503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1300  urea transporter  28.44 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1245  Urea transporter  27.36 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2354  Urea transporter  27.08 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2311  Urea transporter  27.08 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4073  Urea transporter  35.09 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5121  urea transporter  28.35 
 
 		 338 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.47662 
 
 
-
 
NC_004310  BR1363  urea transporter, putative  29.11 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2884  Urea transporter  27.16 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2440  Urea transporter  27.07 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0316485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1462  urea transporter  28.44 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4679  Urea transporter  31.58 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3688  Urea transporter  31.58 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1868  transporter, putative  26.48 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.593615  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4532  Urea transporter  30.24 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1140  Urea transporter  33.22 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39772  predicted protein  28.9 
 
 		 432 aa  49.3  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140327  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5621  Urea transporter  30.18 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2711  putative UreA transporter  32.12 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03500  urea transporter  30.71 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2069  Urea transporter  29.95 
 
 		 281 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000722632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>