26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0234 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0234  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374054  normal  0.278389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2631  hypothetical protein  48.84 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.064289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2623  hypothetical protein  41.25 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11730  hypothetical protein  40.91 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17720  hypothetical protein  36.9 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.877133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2434  hypothetical protein  45.16 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4557  hypothetical protein  38.03 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3857  hypothetical protein  38.03 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4064  hypothetical protein  38.1 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1332  hypothetical protein  38.03 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2867  hypothetical protein  33.77 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2277  hypothetical protein  51.11 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.768372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3494  hypothetical protein  51.11 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.626727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1533  hypothetical protein  32.88 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.555679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22420  hypothetical protein  30.59 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000849865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1503  hypothetical protein  32.1 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269876  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15330  hypothetical protein  46.67 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  40.68 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1897  hypothetical protein  29.41 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.245827  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0042  hypothetical protein  38.64 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0042  hypothetical protein  38.64 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.773701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0045  hypothetical protein  38.64 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0387192  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  36.49 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1112  hypothetical protein  43.94 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.238884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48330  hypothetical protein  32.89 
 
 		 85 aa  40  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629623  normal  0.0634515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3993  hypothetical protein  32.89 
 
 		 84 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0652505  normal  0.145213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>