20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17720 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_17720  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  187  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.877133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11730  hypothetical protein  52.24 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0234  hypothetical protein  36.9 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374054  normal  0.278389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5376  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1824  hypothetical protein  36.05 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  43.64 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  40.32 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3573  hypothetical protein  36.05 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0010  hypothetical protein  36 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000597864  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1332  hypothetical protein  45.65 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  43.64 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0012  hypothetical protein  36 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.383277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4064  hypothetical protein  45.65 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0010  hypothetical protein  36 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3857  hypothetical protein  35.14 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5185  hypothetical protein  36 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.519689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4557  hypothetical protein  45.65 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0367  hypothetical protein  37.1 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3777  hypothetical protein  30 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26386  hitchhiker  0.000401061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3091  hypothetical protein  34.52 
 
 		 85 aa  40  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>