37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4904 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4904  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  203  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  94.06 
 
 		 101 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  93.07 
 
 		 101 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4847  hypothetical protein  93.07 
 
 		 101 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  62.63 
 
 		 101 aa  123  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  48 
 
 		 106 aa  96.7  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3861  chaperone-modulator protein CbpM  42.71 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.346166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1221  chaperone-modulator protein CbpM  41.67 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.874491 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1206  chaperone-modulator protein CbpM  41.67 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.895073  normal  0.418844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1175  chaperone-modulator protein CbpM  41.67 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.585707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1070  chaperone-modulator protein CbpM  41.67 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1186  chaperone-modulator protein CbpM  41.67 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1117  chaperone-modulator protein CbpM  37.5 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2315  chaperone-modulator protein CbpM  37.5 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2125  chaperone-modulator protein CbpM  37.5 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2596  chaperone-modulator protein CbpM  37.5 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1235  chaperone-modulator protein CbpM  37.5 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01009  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1111  chaperone-modulator protein CbpM  37.5 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2643  chaperone-modulator protein CbpM  37.5 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.813926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01002  modulator of CbpA co-chaperone  37.5 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2099  hypothetical protein  38.3 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  38.37 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  37.93 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  34.21 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  34.21 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  36.25 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  36.25 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1383  MerR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  32.56 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  38.6 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2190  hypothetical protein  29.27 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2218  hypothetical protein  29.27 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2405  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663215  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2221  MerR family regulatory protein  39.47 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215829  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  30.86 
 
 		 118 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>